北京青年报记者获悉，新一届中国足协将按照“13部门＋2公司＋1基地”的模式完成内部机构整合，原场馆部、战略规划部等部门及“足城办”将被取消，其原有职能划拨其它部门。中超、中甲、中乙联赛未来大概率将统一由职业联赛公司负责运营，公司名称及具体职能待定。
在本轮换届之前，中国足协是按照“18＋1＋1＋1”的模式设置组织架构的，也就是说足协下设18个职能部门。3个“1”分别指的是中国足协全资子公司福特宝公司、香河国家队训练基地和中足联筹备组（中超公司）。此外，与足协内部管理架构产生交集的还有相对独立的全国足球发展重点城市工作领导小组办公室（简称足城办）。
未来中国足协将下设13个职能部门，分别党办、纪检监督、媒体公关、行政、国际交流、国家队管理、男足青训、女子足球、裁判、竞赛、技术、社会足球、信息管理等部门。原五人制及沙滩足球部、场馆部、会员协会部、财务部、战略规划部等部门将被取消，其原有职能将分别划拨给社会足球、竞赛部、行政部等部门。